1986年10月，根据《中华人民共和国注册会计师法》和《社会团体登记管理条例》的规定，成立了上海市注册会计师协会[SHANGHAI INSTITUTE OF CERTIFIED PUBLIC ACCOUNTANTS（英文缩写SHICPA）]。上海市注册会计师协会是本市注册会计师的行业组织，也是中国注册会计师协会的地方组织。

1997年4月，根据国务院、财政部的部署，经上海市人民政府批准，上海市注册会计师协会召开了特别会议（暨第三届会员代表大会），上海市注册会计师协会和上海市社会审计协会实现了联合，标志着本市的社会审计工作进入了一个新的历史阶段。

2005年10月11日，上海市注册会计师协会召开了第四次会员代表大会；2012年7月5日，召开了第五次会员代表大会；这是行业发展史上的一个重要里程碑。

协会的宗旨是服务、监督、管理、协调、促进。

协会依法接受上海市社会团体管理局的监督管理、接受上海市财政局的监督指导和中国注册会计师协会的指导。

根据本会章程规定，本会会员分为团体会员、个人会员（分为执业会员和非执业会员）。依法批准设立的会计师事务所为本会团体会员。至2016年底，协会有团体会员339家，个人会员27094人，其中，执业会员6278人，非执业会员20816人。

协会最高权力机构为会员代表大会，会员代表大会选举产生理事会。理事会选举产生会长、副会长、秘书长、常务理事。常务理事会在理事会闭会期间行使理事会职权。协会下设秘书处，为其常设执行机构，秘书处现有工作人员23人，内设行政部、综合部、考试培训部、注册部、党办和监管部。

协会先后成立了专业技术委员会、惩戒委员会、申诉维权委员会、《上海注册会计师》编辑委员会、教育培训委员会、注册管理委员会、财务委员会、信息化委员会及保险职业责任专业委员会等9个委员会支持行业工作。

1997年本会创办了协会内刊《上海注册会计师》。

2002年建立了协会网站。